#!/bin/tcsh -ef

echo PWD `pwd`

# CNY-BCH template subjects
set CNYBCH_TEMPLATE_SUBJECTS_DIR = $FREESURFER_HOME/average/CNYBCH

set CNYBCH_SUBJECTS = (Template1 Template2 Template3 Template4 Template5 Template6 Template7 Template8 Template9 Template10 Template11 Template12 Template13 Template14 Template15 Template16 Template17 Template18 Template19 Template20 Template21 Template22 Template23 Template24 Template25 Template26 Template27 Template28 Template29)
set CNYBCH_AGES = (9 7 6 5 18 12 0 0 3 8 10 10 18 4 2 14 3 16 0 12 0 15 5 17 16 0 56 26 56) # age at MRI scan (mo)

set CNYBCH_GMWM_SUBJECTS = (Template5 Template6 Template8 Template10 Template13 Template18 Template20 Template22 Template26 Template27 Template28 Template29)
set CNYBCH_GMWM_AGES = (18 12 0 8 18 16 12 15 0 56 26 56) # (mo)

set CNYBCH_NEONATES = (Template7 Template8 Template19 Template21 Template26)
set CNYBCH_NEONATEAGES = (3 4 1 2 4) # days (first two computed from weeks)

set CNYBCH_AROUNDONE = (Template11 Template12 Template6 Template20 Template16)
set CNYBCH_AROUNDONEAGES = (10 10 12 12 14) #mo

set CNYBCH_SUBJECTS_AGESORTED = (Template19 Template21 Template26 Template7 Template8 Template15 Template17 Template9 Template14 Template23 Template4 Template3 Template2 Template10 Template1 Template11 Template12 Template20 Template6 Template16 Template22 Template18 Template25 Template24 Template13 Template5 Template28 Template27 Template29)
set CNYBCH_AGES_SORTED = (0 0 0 0 0 2 3 3 4 5 5 6 7 8 9 10 10 12 12 14 15 16 16 17 18 18 26 56 56) # months 

